（司令官補佐官）第二条統合作戦司令部に、司令官補佐官一人（関係のある他の職を占める者をもって充てられるものとする。）を置く。２司令官補佐官は、事務官をもって充てる。３司令官補佐官は、統合作戦司令官の命を受け、統合作戦司令部の事務の適正かつ円滑な遂行を図る見地から、統合作戦司令部の事務に関する重要事項に係る方針及び計画の立案に関し助言し、並びに統合作戦司令部の事務に関し重要事項について必要な調整を行う。
（情報第一課）第五条情報第一課は、次の事務をつかさどる。一情報の収集整理に関する業務計画に関すること。二情報の収集整理に関する調査及び研究に関すること。三自衛隊の部隊の行動に関し必要な情報計画の作成に係る情報の収集整理の調整に関すること。四秘密の保全に関すること。五部内の事務の総括に関すること。
（情報第二課）第六条情報第二課は、次の事務をつかさどる。一自衛隊の部隊の行動に関し必要な情報見積り及び情報計画に関すること（情報第一課の所掌に属するものを除く。）。二資料及び情報の収集整理及び配布の実施に関すること。
（作戦企画課）第八条作戦企画課は、次の事務をつかさどる。一自衛隊の部隊の行動に関する実施計画の総合調整に関すること。二防衛及び警備の実施計画に関すること。三統合作戦司令部の定員、編成、装備及び配置の実施計画に関すること。四業務計画の作成及びその実施の調整に関すること。五部内の事務の総括に関すること。
（作戦第一課）第九条作戦第一課は、次の事務をつかさどる。一武力攻撃事態等及び存立危機事態における我が国の平和と独立並びに国及び国民の安全の確保に関する法律（平成十五年法律第七十九号）第二条第八号に規定する対処措置又は同法第二十二条第三項に規定する緊急対処措置に係る自衛隊の部隊の行動に関すること。二重要影響事態に際して我が国の平和及び安全を確保するための措置に関する法律（平成十一年法律第六十号）第二条第一項に規定する対応措置に係る自衛隊の部隊の行動に関すること。三前二号に掲げるもののほか、自衛隊法（昭和二十九年法律第百六十五号）第七十八条の規定による命令による治安出動、同法第七十九条の規定による治安出動待機命令、同法第七十九条の二の規定による治安出動下令前に行う情報収集、同法第八十一条の規定による要請による治安出動、同法第八十一条の二の規定による自衛隊の施設等の警護出動、同法第八十二条の規定による海上における警備行動、同法第八十二条の三の規定による弾道ミサイル等に対する破壊措置及び同法第八十四条の規定による領空侵犯に対する措置に係る自衛隊の部隊の行動に関すること。四防衛省設置法（昭和二十九年法律第百六十四号）第四条第一項第十八号に規定する調査及び研究のうち、前各号に係る自衛隊の部隊の運用に関すること。
（作戦第二課）第十条作戦第二課は、次の事務をつかさどる。一自衛隊の部隊の行動に関すること（作戦第一課、訓練課、後方運用課及び衛生運用課の所掌に属するものを除く。）。二防衛省設置法第四条第一項第十八号に規定する調査及び研究のうち、前号に係る自衛隊の部隊の運用に関すること。
（部長、副部長及び課長）第十五条部に部長を、課に課長を置く。２作戦部に、副部長一人を置く。３前二項の職は、自衛官をもって充てる。４部長は、統合作戦司令官の命を受け、部務を掌理する。５副部長は、部長を助け、部長に事故があるとき、又は部長が欠けたときは、その職務を行う。６課長は、部長の命を受け、課務を掌理する。
（総務官）第十六条統合作戦司令部に、総務官一人を置く。２総務官は、自衛官をもって充てる。３総務官は、統合作戦司令官の命を受け、次の事務をつかさどる。一統合作戦司令官の官印及び統合作戦司令部印の保管に関すること。二公文書の接受、発送、編集及び保存に関すること。三文書の審査（法務官の所掌に属するものを除く。）及び進達に関すること。四統合作戦司令官及び統合作戦副司令官の庶務に関すること。五各部、指揮通信運用官及び法務官の事務の連絡調整に関すること。六業務計画の方式、作成、実施及び実施の検討の手続並びに業務計画の実施の検討に関すること。七隊務の能率的運営及び報告統制に関すること。八統計に関すること。九監察に関すること。十渉外に関すること。十一経費及び収入の予算、決算及び会計に関すること。十二旅費に関すること。十三給与及び会計の事務処理手続に関すること。十四自衛隊の部隊の行動に関する人事見積り及び人事の計画に関すること。十五隊員の任免、分限、懲戒、服務、規律その他の人事に関すること。十六隊員の補充に関すること。十七礼式及び表彰に関すること。十八隊員の災害補償に関すること。十九隊員の福利厚生に関すること。二十前各号に掲げるもののほか、統合作戦司令部の事務で他の課又は官の事務に属しないものに関すること。
（指揮通信運用官）第十七条統合作戦司令部に、指揮通信運用官一人を置く。２指揮通信運用官は、自衛官をもって充てる。３指揮通信運用官は、統合作戦司令官の命を受け、次の事務をつかさどる。一指揮通信の計画に関すること。二通信及び電波の使用及び監理に関すること。三統合作戦司令部の情報システムの整備及び管理に関すること。四統合作戦司令部の暗号に関すること。
（法務官）第十八条統合作戦司令部に、法務官一人を置く。２法務官は、自衛官をもって充てる。３法務官は、統合作戦司令官の命を受け、次の事務をつかさどる。一訴訟、損害賠償及び損失補償に関すること。二例規案その他特に命ぜられた重要な文書の審査に関すること。三法令の調査及び研究に関すること。